TRANSFAC(R): 転写調節、パターンからプロファイルへ

真核生物の転写調節に関するTRANSFACデータベースは、転写因子、ターゲット遺伝子、および調節結合部位に関するデータを含んでおり、エントリーの数と収集データの範囲と構造の両方で拡張およびさらに発展しました。人間およびマウスの転写因子に対して、解剖構造と発達段階に関するCYTOMERデータベースを使用した表現パターン用の構造化されたフィールドが導入されました。転写因子結合部位のマトリックスベースの検索ツールであるMatchの機能が強化されました。たとえば、プログラムには、いくつかの組織（または状態）特異的プロファイルが用意されており、新しいプロファイルをMatch Profilerを使用して作成および修正できます。GENEテーブルは拡張され、LocusLink、RefSeq、OMIMへのリンクを含む重要性が増しています。さらに、因子とターゲット遺伝子の間、および遺伝子とコーディング因子の間の（直接）リンクが導入されました。TRANSFACの公開リリースはhttp://www.gene-regulation.comで入手可能です。酵母については、最新のデータを含む追加のリリースがTRANSFAC Saccharomyces Module（TSM）として別途http://transfac.gbf.deで入手可能です。CYTOMERの無料ダウンロード版はhttp://www.biobase.de:8080/index.htmlで入手可能です。