メガベースサイズのゲノムのための低コスト多重ライブラリ調製

全ゲノムシーケンシングは現代生物学に不可欠なツールとなっています。しかし、サンプル調製のコストはシーケンシングのコストに対して相対的に高いままであり、特に小さなゲノムでは前者が主導的です。ここでは、Illuminaシーケンシングのための数百の多重ゲノムライブラリの迅速かつ低コストな調製に関するプロトコルを提示します。小さなボリュームでNexteraタグメンテーション反応を行い、高価な試薬を安価な同等物に置き換え、不必要なステップを省略することにより、ライブラリ準備のコストをサンプルあたり8に達成し、標準のNextera XTプロトコルの約6倍安価です。さらに、我々の手順は96サンプルで5時間未満で済みます。その後、数百のサンプルをカスタムバーコードを介して同じHiSeqレーンでプールすることができます。我々の方法は、進化実験、遺伝子スクリーニング、および環境サンプルを含む微生物またはウイルスのゲノムの再シーケンシングや、大規模アンプリコン、オープンクロモソーム、人工クロモソーム、RNAシーケンシングなどの他のシーケンシングアプリケーションにも役立ちます。