2つのスペインのモモ遺伝資源コレクションを使用したモルフォロジーと品質特性の遺伝的多様性とゲノム全体関連研究

(L.) Batsch] は、世界生産において最も重要な核果類の一つです。スペインのモモ生産は現在、世界で2番目に大きく、スペインで利用可能な品種は果実の品質特性や収穫後の障害において大きな遺伝的多様性を持っています。スペインの遺伝資源における遺伝的多様性と一塩基多型（SNP）-特性の関連を探るために、新しい桃18K SNP v2アレイを用いて、アラゴンの農食品研究技術センター（CITA）およびアウラ・デイの実験ステーション（EEAD）-CSICに配置された2つの国家モモ遺伝資源コレクションに属する287アクセッションを遺伝子型決定しました。新しいSNPアレイの高密度化により、従来の低密度マーカーでは特定できなかった30の同義群が同定されました。さらに、「スタークレスト」と呼ばれる「スプリングクレスト」の変異体において、13.5 Mbの領域の染色体置換の可能性のある大規模な分子イベントが検出されました。スペインの多様化地域に関する以前の提案は、高密度マーカーを使用した遺伝的多様性と連鎖不均衡（LD）崩壊の結果と一致しました。ゲノム全体関連研究（GWAS）では、葉腺のタイプ（TLG）、果実の毛質（FH）、および果肉の質感（FT）との34の重要なSNP-特性関連が検出されました。重要なSNPの影響はSnpEffで調査されました。候補遺伝子は、毛状体形成およびうどんこ病抵抗性に関与するいくつかの重要なファミリープロテインをコードしています（桃のTLGに関連）。得られた品種間の遺伝的距離とともに発見されたSNP-特性の関連は、桃の育種プログラムにおけるマーカー支援選抜および交配アプローチに新たな知見を提供します。