Porphyromonas gingivalis株ATCC 33277のゲノム配列の決定と株W83とのゲノム比較により、P. gingivalisにおける広範なゲノム再配置が明らかになった

グラム陰性の嫌気性細菌Porphyromonas gingivalisは、慢性歯周病の主要な原因微生物です。Porphyromonas gingivalis株は、マウス皮下軟部組織膿瘍モデルの分析によって、病原性のある株と病原性の低い株に分類されています。ここでは、病原性の低い株に分類されるP. gingivalis ATCC 33277の全ゲノム配列を提示します。ATCC 33277ゲノム内には、2090のタンパク質コーディング配列（CDS）、4つのRNAオペロン、53のtRNA遺伝子が同定されました。病原性株W83とのゲノム比較により、461のATCC 33277特異的および415のW83特異的CDSが同定されました。両株間で広範なゲノム再配置が観察され、175のゲノム再配置が発生した領域が同定されました。それらのゲノム再配置のうち35は反転または転座であり、140は単純な挿入、欠失または置換でした。両株には、遺伝子再配置と頻繁に関連する挿入配列、小型逆繰り返し移動因子（MITE）、接合性トランスポゾンなどの大量の移動要素が含まれていました。これらの発見は、移動遺伝因子がP. gingivalisの広範なゲノム再配置および多くの株特異的CDSの発現に深く関与していることを示唆しています。また、繰り返し配列を持つP. gingivalisのMITE、MITE400をMITEPgRS（繰り返し配列を持つP. gingivalisのMITE）と名付け、その非常にユニークな特徴についても述べます。