c302: C. elegans の神経系をモデル化するためのマルチスケールフレームワーク

OpenWormプロジェクトは、線虫Caenorhabditis elegansの非常に詳細なインシリコモデルを作成するという野心的な目標を持っています。この作業の重要な部分は、すべての既知の細胞型と接続を含む神経系のモデルです。ワームの観察された高レベルの行動を再現するために、神経モデルに必要な生物物理学的詳細の適切なレベルはまだ決まっていません。この理由から、私たちは、解剖学的および生理学的詳細の異なるレベルを取り入れた神経ネットワークの異なるインスタンスを生成できるフレームワーク、c302を開発しました。これにより、それらを独立して調査および洗練したり、OpenWormモデリングツールチェーンで開発された他のツールにリンクさせたりすることができます。この記事は、「コネクトームから行動へ：細胞解像度でのC. elegansモデリング」という討論会の特集号の一部です。