細菌マイコプラズマ肺炎球菌の全ゲノム配列解析

細菌マイコプラズマ肺炎球菌 M129 の全ゲノムが配列決定されました。そのサイズは816,394塩基対で、平均G+C含量は40.0 mol%です。我々は677のオープンリーディングフレーム（ORFs）と39の遺伝子が様々なRNA種をコードしていると予測しています。予測されたORFのうち、75.9%が他の生物の遺伝子/蛋白質と有意な類似性を示し、9.9%のみがデータベース内の遺伝子配列に対して有意な類似性を示しませんでした。これにより、大量のORFに機能的分類を仮に割り当て、この細菌の生化学的および生理学的特性を推測することが可能になりました。M. pneumoniaeは、祖先の細菌からの還元的進化の過程でゲノムサイズが減少することは、完全なアナボリック（例えば、アミノ酸合成なし）および代謝経路の喪失によって説明できます。したがって、M. pneumoniaeは本質的に外因性の必須代謝物の提供を必要とする強制寄生生活様式に依存しています。すべての主要な細胞プロセスおよび代謝経路のクラスは簡単に説明されています。実験的な証拠に基づきM. pneumoniaeに存在する多くの活動/機能に関して、対応する遺伝子は類似性検索によって特定できませんでした。例えば、運動性、化学走性、および酸化ストレスの管理に関与する遺伝子/蛋白質を特定できませんでした。