タンパク質ドメインファミリーのProDomデータベースの最近の改善

ProDomデータベースは、SWISS-PROTデータベースから自動列比較によって生成されたタンパク質ドメインファミリーを含んでいます。現在のバージョンは、再帰的PSI-BLAST相同性検索に基づいた新しい改善された手法で構築されました。ProDomは、ユーザーフレンドリーなグラフィカルインターフェース（http://www.toulouse.inra.fr/prodom.html）を利用して、既知のファミリーや新しいタンパク質内のドメイン配置を研究するために、ワールドワイドウェブ上で検索可能です。ProDomサーバーへの最近の改善には、SRS配列取得システム下でのProDomクエリ、PredictProteinサーバーへのリンク、より大きなドメインファミリーのより良い表現のための系統樹と凝縮された多重配列アラインメント、ズームイン・アウト機能が含まれます。さらに、17の完了した微生物ゲノムに適用された全ゲノムドメイン分析の結果を表示するための同様のサーバーが設置されました（http://www.toulouse.inra.fr/prodomCG.html）。