高マンノース糖鎖フラグメントのイオン移動度分離から得られた異性体情報

移動波イオン移動度分離の前に生成された負イオンCID由来のフラグメントの抽出された到着時間分布が、N結合糖鎖に関する構造情報を提供する能力について評価されました。ウイルス由来のものを含むいくつかの糖タンパク質から放出された高マンノース糖鎖の断片化は50以上のフラグメントを提供し、その多くは独自の衝突断面積を示し、構造異性体を特定するために使用される追加情報を提供しました。たとえば、Man8GlcNAc2異性体上の還元末端GlcNAc残基の切断から生じる環断片は、異性体を混合物中で区別可能にする独自の衝突断面積を持っています。特定のフラグメントの衝突断面積は、抗原性的なα-ガラクトース残基で終端する糖鎖を特定するのを可能にし、いくつかの糖鎖の6つのアンテナの構成を定義するイオンも、同じスペクトルで生成された異性体イオンとは異なる衝突断面積を持つことが確認されました。さまざまなイオンの形成の潜在的メカニズムについて議論され、推定された衝突断面積が表形式で示されています。