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モデル生物は、病原体の可能性のある存在を検出するため(インデックス機能)または処理プロセスの性能を評価するため(指標機能)に使用できる。FRNAファージのインデックス機能を評価するために、その生態が研究された。これらのファージは、人間、犬、牛、馬の糞便には存在せず、豚や子牛の糞便には比較的少数しか存在しないことが示された。ブロイラー鶏の糞便からは高いカウント(103-107 pfu/g)が得られた。さまざまな種類の廃水では、カウントは通常103から104 pfu/mlの範囲であった。これらの高いカウントは、直接的な糞便入力では説明できなかった。FRNAファージの環境での増殖は、F-ピリを持つ細菌宿主株の必要性のため、ありそうにないと考えられた。これらは30°C以上の温度でのみ産生される。しかし、宿主細胞が37°Cで事前に増殖された場合(例えば、恒温動物の腸内で)、環境温度に転送されるとFRNAファージの増殖が起こることも示された。したがって、環境サンプル内のFRNAファージの存在は、間接的に糞便汚染と関連している。
Havelaar et al. (Tue,) はこの問題を研究した。