MALDI-四重極イオントラップ質量分析計によるタンパク質の自動同定

新しい設計のマトリックス支援レーザー脱着/イオン化（MALDI）イオントラップ質量分析計について説明します。この装置は、商業用のFinnegan LCQイオントラップ質量分析計に基づいており、コンパクトディスクで構築されたサンプルステージと新しいイオン伝送インターフェースを含むMALDIイオン源を追加しました。イオンインターフェースは、元の装置構成のスキマーとオクタポールの間に設置された四重極イオガイドを含んでおり、MALDIおよびエレクトロスプレーイオン化モードの両方での操作を可能にします。この装置はペプチドに対してフェムトモル感度を持ち、短時間で多数のMALDI MSおよびMALDI MS/MSスペクトルを収集することができます。MALDIソースは、10(4)-10(5)レーザーパルスに対して再現可能な信号を生成し、MSペプチドマップで検出されるすべての識別可能な単一荷電イオンからMS/MSスペクトルを収集することを可能にします。私たちは、装置の動作モードと、困難なタンパク質同定問題に適用されるデータ処理アルゴリズムについて説明します。