マイクロRNA標的部位に位置するSNPの異常アリル頻度は人間の癌と関連している可能性がある

マイクロRNA（miRNA）は、ターゲットmRNAの3'-末端非翻訳領域（3'-UTR）と塩基対を形成することにより遺伝子発現を調節する非コード小RNAのクラスであり、mRNA切断または翻訳抑制を引き起こします。マイクロRNA結合部位に位置する一塩基多型（SNP）（miRNA結合SNP）は、miRNAの標的の発現に影響を及ぼし、一般的な疾患に対する人間の感受性に寄与する可能性があります。本研究では、さまざまなヒト遺伝子の3'-UTRのmiRNA結合部位に位置するSNPの全ゲノム解析を行いました。miRNA結合SNPは、miRNA結合の「シード」配列と全体の3'-UTR配列の間のSNP分布に関して負の選択を受けていることを発見しました。さらに、ESTデータベースを利用して、癌と正常組織における各miRNA結合SNPの発現を包括的に定義しました。興味深いことに、いくつかのmiRNA結合SNPは、ヒト癌のESTライブラリとdbSNPデータベースの間で有意な異なるアリル頻度を示しました。さらに重要なことに、症例対照関連研究のためにdbSNPデータベースに対するヒト癌標本を使用すると、12のmiRNA結合SNPが実際にヒト癌において異常なアリル頻度を示すことが分かりました。したがって、miRNA結合部位に位置するSNPはmiRNAの標的発現と機能に影響を及ぼし、癌と関連している可能性があります。