統計的結合解析から得られたスコアを用いたデノボタンパク質構造予測における正しいフォールドと誤ったフォールドの識別

ネイティブフォールドと非ネイティブフォールドを区別することは、タンパク質構造予測において依然として難しい問題です。私たちは、デノボタンパク質構造予測法によって生成されたネイティブフォールドと非ネイティブフォールドを区別する統計的結合解析に基づく手法、SCA-距離スコアリングについて説明します。この手法は、5つの試験タンパク質のうち4つに対して効果的です。この手法は、真のフォールドに対してRMSDが近い非ネイティブフォールドを特に良好に区別しますが、内部構造要素の変化を含んでいます。SCA-距離スコアリングは、タンパク質構造予測におけるネイティブフォールドと非ネイティブフォールドを区別するためのツールに有用な追加です。