リーダーに従う：異なる生物のタンパク質における初期メチオニンに続く特定のアミノ酸の優先性

すべての分類群および種のタンパク質の大多数はAUGコドンによって開始され、アミノ酸メチオニン（Met）に翻訳されることが確立されています。開始コドンを囲む配列の重要性を評価する試みが多く行われ、主にRNA配列に焦点が当てられました。しかし、開始メチオニン残基に続くアミノ酸の役割と重要性は、主に細菌や真菌でほとんど調査されていませんでした。本研究では、Swiss-Protデータベースに表現されるすべての主要な分類群のタンパク質配列を計算的に調べ、初期メチオニンに直接続く位置での特定のアミノ酸に対する各群の好みを評価しました。その結果、タンパク質配列の大多数において、種特異的な第二アミノ酸の好みがあることが示されました。興味深いことに、第二位置での特定のアミノ酸に対する好みは、原核生物のリシンから低等原生生物のセリンを経て、高等植物および動物のアラニンへと進化の過程で変わります。