GeneDive: 精密医療を促進するための遺伝子相互作用検索及び視覚化ツール

遺伝子相互作用に関する関連情報を取得することは、疾病プロセスと治療の理解において重要です。テキストマイニングアプローチの普及に伴い、こうしたバイオメディカルデータの量は急速に増加しており、その結果、データ利用者にとって新たな問題である情報過多が生じています。研究者が疾患や薬剤応答の背後にある生物学的メカニズムを理解するのを助け、最終的には患者を助ける、バイオメディカルデータの効率的なクエリと視覚化を行うツールが強く求められています。この目的のために、私たちはGeneDiveを開発しました。GeneDiveは、大量の遺伝子相互作用データのためのウェブベースの情報取得、フィルタリング、視覚化ツールです。GeneDiveは、ユーザーを検索プロセスを通じてガイドし、彼らが興味のある情報に効率的に到達するためのさまざまな機能やモダリティを提供します。GeneDiveは現在、300万以上の遺伝子-遺伝子相互作用を処理し、応答時間は数秒以内です。4つの著名なデータベースから取得したキュレーションされた遺伝子セットの半分以上において、80％以上の遺伝子セットメンバーがGeneDiveによって回収されています。近い未来、GeneDiveは遺伝子-薬剤や遺伝子-疾患相互作用など、他の相互作用タイプもシームレスに扱えるようになり、精密医療などのトピックをフルに探求できるようになります。GeneDiveアプリケーション及びその基盤となるシステムアーキテクチャに関する情報はhttp://www.genedive.netで入手可能です。