Key points are not available for this paper at this time.
要旨 新しい分子表面積の計算方法の開発について報告する。我々の技術はSharakeとRupleyの方法に基づいているが、いくつかの主要な進歩を取り入れている。まず、表面点の状態をビット列のビットとして表現し、ブーリアン演算を利用して1つのブーリアンAND演算で複数のテスト点を同時にオフにすることができる。次に、一連のブーリアンマスクルックアップテーブルを使用して、分子表面積の計算の時間的複雑性をポテンシャルエネルギー評価と同じオーダーに削減する。BPTI中の全原子に対して256の表面点球体を使用し、454の非水素原子を持つタンパク質と1.4 Åの溶媒プローブを用いると、一般的に、広範な構造にわたって約1.25%の範囲で合計溶媒アクセス表面積（SASA）を過小評価し、相関係数は0.9990である。BPTIコンフォーマのSASAを計算するのに必要な平均CPU時間はSGI 4D/220ワークステーションで0.58秒である。また、BPTIの近似有限差分SASA勾配を0.79のCPU時間で計算する方法についても説明する。© 1993 John Wiley & Sons, Inc.
Grand et al. (Mon,) はこの問題を研究した。