サンフランシスコ湾河口におけるアンモニア酸化古代細菌とバクテリアの相対的な豊富さと多様性

海洋および河口の沈 sediments におけるアンモニア酸化は、窒素の循環と除去において重要な役割を果たしています。最近の報告では、新たに発見されたアンモニア酸化古代細菌が水生および陸上生態系において豊富かつ多様であることが示されています。本研究では、アメリカ西海岸最大の河口であるサンフランシスコ湾の物理化学的勾配におけるアンモニア酸化古代細菌 (AOA) とベータプロテオバクテリア (ベータ-AOB) の豊富さと多様性を調査しました。AOA が陸上および海洋システムの両方でベータ-AOB よりはるかに豊富であるとの報告とは対照的に、私たちの定量的PCR推定値は、ほとんどの河口でベータ-AOB amoA（アンモニア一酸化酵素サブユニット A をコードする）コピー数が AOA amoA よりも多いことを示しました。アンモニア酸化古代細菌は、河口の低塩分域でのみベータ-AOB よりも広範囲に分布していました。AOA とベータ-AOB のコミュニティは、河口内で明確な空間構造を示しました。河口の北部の AOA amoA 配列は、大きく明確な低塩分系統群を形成しました。ベータ-AOB の配列の大多数は、他の海洋/河口のナイトロソモナス様およびナイトロソスピラ様の配列と密接に関連していました。アンモニア酸化細菌のコミュニティ構成と豊富さは塩分と強く相関していました。アンモニア酸化の濃縮文化には、環境配列と高い類似性を持つ AOA とベータ-AOB amoA 配列が含まれていました。全体として、本研究は河口のアンモニア酸化微生物群集に関する理解を大幅に深め、異なる AOA とベータ-AOB 系統型が繁栄できる環境条件や生息地を浮き彫りにしています。