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配偶子頻度における集団差を測定しテストするための一般的手順が説明されている。集団間の総分散は階層的に細分化される。複数座の処理は、配偶子平衡が座間に成立する限り、単一座の分析の合計に過ぎない。配偶子平衡が成立しない場合、座間の相関関係に対処する必要がある。この分析は、南アメリカの2つのインディアン部族、イエクアナ(マキリタレ)とヤノママの遺伝的基盤を調べるために使用される。歴史的証拠から、各部族内の村の「クラスター」を特定できる。村の形成に影響を与える人口動態や文化的慣習は、これらの部族ではかなり異なり、村間の遺伝的変異の異なるパターンを仮定させる。5つの共優性の二対立遺伝子座、4つの優性の二対立遺伝子座、そして4つの共優性ハプロタイプを持つ2つの複雑な座の分析は、ヤノママのクラスターがイエクアナのクラスターよりもより異なることを示しており、社会文化的な観点から予測される結果である。
Smouseら(Wed)がこの問題を研究した。