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中国の武漢市でのウイルス性肺炎の現在の outbreak は、ウイルスRNAゲノムの配列解析により、世界保健機関によって2019-nCoVと指定された新しいコロナウイルスによって引き起こされました。最初の患者の多くは、家畜、蛇、コウモリ、その他の農場動物が販売されている華南海鮮卸売市場で野生動物に接触していました。ウイルスの貯蔵庫の可能性を調査するため、2019-nCoVの配列に基づいて、異なる動物種間の相対的同義コドン使用(RSCU)バイアスと共に、包括的な配列解析と比較を行いました。私たちの分析から得られた結果は、2019-nCoVがコウモリコロナウイルスと起源不明のコロナウイルスの間の再組換えウイルスである可能性があることを示唆しています。再組換えは細胞表面受容体を認識するウイルススパイク糖タンパク質内で発生した可能性があります。さらに、私たちの発見は、2019-nCoVがコウモリのコロナウイルスと最も類似した遺伝情報を持ち、蛇とのコドン使用バイアスが最も類似していることを示唆しています。合わせて、私たちの結果は、相同組換えが発生し、2019-nCoVの種を超えた伝播に寄与する可能性があることを示唆しています。
Ji et al. (Wed,) はこの問題を研究しました。