新しいクローン病の遺伝子座が5p13.1の遺伝子デザートにマッピングされ、PTGER4の発現を調節することが確認されました

クローン病（CD）の新しい感受性遺伝子座を特定するために、私たちは547人の患者と928人の対照において特徴づけられた30万以上のSNPを使用した全ゲノム関連解析を行いました。p値が10(-6)から10(-9)の範囲で、疾患関連の証拠を提供する3つの染色体領域を見つけました。そのうちの2つ（染色体1のIL23Rおよび染色体16のCARD15）は、以前にCDと関連付けられた遺伝子に対応しています。さらに、染色体5p13.1の250-kb領域には、疾患関連の強い証拠を示す複数のマーカーが含まれていることが判明しました（p < 10(-7)の4つのマーカーを含む）。私たちは、1,266人の追加CD患者、559人の追加対照、および428のトリオを調査することにより、5p13.1の結果を再現しました。再現データを用いた症例/対照比較で有意な関連の証拠（p < 4 x 10(-4)）が見つかり、関連アレルが影響を受けた子孫に過剰に伝達されていることが示されました（p < 0.05）。これにより、5p13.1の遺伝子座がCD感受性に寄与していることが確認されました。CD関連の250-kb領域は、111のSNPマーカーで飽和状態でした。ハプロタイプ分析は、疾患感受性に寄与する複数の変異を持つ複雑な遺伝子座の構造を支持しています。新しい5p13.1のCD遺伝子座は、1.25-Mbの遺伝子デザート内に位置しています。私たちは、疾患関連のアレルが近接する遺伝子PTGER4の定量的発現レベルと相関することを示す証拠を提示します。私たちの結果は、CDにとって重要な新しい感受性遺伝子座を特定し、この遺伝子座での疾患リスクに関連する遺伝的変異がPTGER4のシス作用型調節要素を調節する可能性があることを示唆しています。