バイオメディカル文献のナビゲーションのためのiHOP概念の実装

動機付け：ワールドワイドウェブは、情報へのアクセス方法を根本的に変えました。インターネットの検索は簡単で迅速ですが、より重要なことに、関連するコンテンツの相互接続は直感的であり、人間の記憶の連想的な組織に近づきます。しかし、現在生物学および医療の研究者に利用可能な情報検索ツールは、一般の人がインターネットから期待する可能性に大きく遅れています。結果：PubMedの情報は、文や要約の間をハイパーリンクとして遺伝子やタンパク質を使用することで、ナビゲート可能なリソースに変換できる。iHOP（Information Hyperlinked over Proteins）は、この遺伝子ガイドネットワークを自然な方法で提供し、何百万ものPubMed要約にアクセスし、インターネットのすべての利点を科学文献研究にもたらすオンラインサービスです。このネットワーク内で互いに関連する文をナビゲートすることは、従来のキーワード検索よりも人間の直感に近いものであり、情報を段階的かつ制御された形で取得することを可能にします。さらに、この文献ネットワークは、実験的相互作用データに重ねることができ、新しい知識と既存の知識の同時分析を促進します。iHOPに提示されているネットワークは、現在、ヒト（Homo sapiens）、マウス（Mus musculus）、ショウジョウバエ（Drosophila melanogaster）、線虫（Caenorhabditis elegans）、ゼブラフィッシュ（Danio rerio）、アラビドプシス（Arabidopsis thaliana）、酵母（Saccharomyces cerevisiae）および大腸菌（Escherichia coli）の5百万文と40,000遺伝子を含んでいます。利用可能性：iHOPはhttp://www.pdg.cnb.uam.es/UniPub/iHOP/で自由にアクセスできます。