Saccharomyces cerevisiaeにおける局所的な規制変異

遺伝子発現に影響を与える自然に発生する配列変異は、種内の個体間の表現型の違いの重要な源です。我々及び他の研究者は、このような規制変異が、発現に影響を与える遺伝子と同じ座位で（局所的な規制変異）、および転写因子の別の場所で発生することができることを示しています。ここでは、Saccharomyces cerevisiaeにおける全ゲノム規模の局所的な規制変異の詳細な分析を提示します。遺伝子連鎖解析を用いて、ほぼ4分の1の酵母遺伝子が2つの異なる系統間で局所的な規制変異を含むことを示しました。我々は、強い自己連鎖を示す77遺伝子に対して、2つの系統の二倍体ハイブリッドにおけるアレル特異的発現を測定し、これらの遺伝子の52%〜78%において、局所的な規制変異がcisで直接作用することを発見しました。また、遺伝子AMN1における局所的な規制変異がフィードバックループを介してtransで作用する1つの例を実験的に確認しました。全ゲノムの配列解析により、局所的な規制変異を受ける遺伝子がプロモーター領域において多様性の増加を示し、この増加の一部は予測された転写因子結合部位における多型によるものであることが明らかになりました。また、これらの遺伝子の3'非翻訳領域にも多様性の増加が見られました。これらの発見は、cis作用の変異の重要性を示唆していますが、同時に局所的な変異が遺伝子発現レベルに影響を与える多様なメカニズムがあることも示唆しています。