EnzymeDetector: 統合された酵素機能予測ツールおよびデータベース

背景：酵素の機能を正確に予測する能力は、細胞機能の解釈や代謝モデルの再構築および分析にとって重要な前提条件です。このような情報を提供する生物学的データベースはいくつか存在します。しかし、多くの場合、これらのデータベースは異なった一貫性のないゲノム注釈を提供しています。説明：私たちは9つの原核生物のゲノムを分析し、主要な注釈リソースの酵素予測に約70%の不一致があることを発見しました。したがって、私たちは注釈パイプラインEnzymeDetectorを実装しました。このツールは、主要な注釈データベースから割り当てられた酵素機能を自動的に比較・評価し、自身の機能予測で補完します。これは、配列類似性解析、BRENDA（ブラウンシュヴァイク酵素データベース）からの手動作成の生物特異的酵素情報、および配列パターン検索に基づいています。結論：EnzymeDetectorは、関心のあるゲノムの利用可能な酵素機能注釈の迅速かつ包括的な概要を提供します。Webインターフェースにより、ユーザーは異なる予測方法に対してカスタマイズ可能な重み付けスキームおよびカットオフで作業することができます。これらのカスタマイズされた品質基準は簡単に適用でき、結果として得られる注釈はダウンロード可能です。使用されたすべての注釈ソースの要約されたビューは最新の情報を提供します。データベースの1つでのみ発生する注釈エラーは、その低い関連性スコアのために認識されることができます。結果はデータベースに保存され、http://enzymedetector.tu-bs.de でアクセス可能です。