新しいC型肝炎ウイルスの分析と既存変異体との系統的関係

C型肝炎ウイルス（HCV）の5'非コーディング領域（5'NCR）から、スコットランドの献血者から得られた配列を取得し、以前に発表されたHCV配列と比較しました。系統解析により、3つの異なる配列群が存在することが明らかになりました。これらのうちの2つは、最近記述されたHCVタイプ1および2の変異体に対応していましたが、約3分の1の献血者で検出されたウイルス配列は、恐らく新しいウイルス種による感染を示す別の系統群を形成しました。この後者の群のヌクレオチド配列は、以前に発表されたすべての5'NCR配列変異体とは少なくとも9%異なっていました。この新しいウイルス型は、ウイルスゲノムの他の領域（コア、NS-3、NS-5）においても、以前に発表された変異体とはかなり異なり、プロトタイプのHCV-1配列からそれぞれ15%、43%、49%の修正されたヌクレオチド距離がありました。各コーディング領域の正式な系統解析により、HCVタイプ1の変異体は地域変異体（極東および米国/欧州）に明確に区別できることが確認されましたが、U.K.の献血者における主要なHCVタイプの地理的分布は明確に重なっていました。この研究で特定された3つの主要系統群がHCVの別種を示しているという仮説への証拠を議論します。