C. difficileは成人に過剰診断される可能性があり、乳児に一般的に存在する共生菌である

要旨：Clostridioides difficileは、世界中の院内感染において緊急の脅威であるが、C. difficileに関連する微生物組成、特にC. difficile感染（CDI）例においては十分に特徴付けられていない。CDI患者の腸内マイクロバイオームの組成を調査するために、10の公に利用可能なCDI研究集団から534のメタゲノムを分析した。その後、C. difficileをグローバルな規模で追跡し、253の公的研究から42,900のメタゲノムをスクリーニングした。CDIコホートの中で、CDI患者の便検体からC. difficileを検出したのはわずか30%であった。しかし、CDIのような症状を引き起こすことができる他の多くの毒素産生種が一般に存在することがわかった。さらに、調査対象となった研究の大多数が正しいCDI診断のための推奨ガイドラインに従っていなかった。グローバル調査では、C. difficileの有病率、豊富さ、生物的文脈は年齢依存であることがわかった。C. difficileは健康な成人の多様性が減少することに関連するまれな分類群であるが、乳児においては一般的で、増加した多様性に関連している。C. difficileと共生する種のグループを健康な乳児のみに特異的に同定し、好気性細菌に富み健康な成人の腸内マイクロバイオームに典型的な種が豊富であることがわかった。したがって、健康な乳児におけるC. difficileは健康な腸内マイクロバイオームの成熟の複数の指標に関連した。この分析は、CDIの過剰診断の可能性について懸念を呼び起こし、C. difficileが乳児において重要な共生菌であり、その成人における無症状の持続は微生物の文脈に依存していることを示唆している。