プライマーオリゴベース延長および質量分析法を用いたCFTR遺伝子変異の検出

関連する診断製品の検出を伴うDNAの局所的変動を信頼性高く特定するための新しい方法が、マトリックス支援レーザー脱着イオン化時間飛行質量分析（MALDI-TOF MS）を用いて説明されています。この診断製品は、ターゲットストランドの変動部位の下流にある領域に対する単一の検出プライマーを必要とするプライマーオリゴベース延長（PROBE）反応によって生成されます。ポリメラーゼ、三つのdNTP、およびジデオキシ形の第四ヌクレオチドを加えると、プライマーは変異領域を通じて延長され、最初のddNTPが組み込まれるまで延長が続きます。延長生成物の質量が変動部位の組成を決定します。二つのエクソン11部位がバイプレックス反応で測定される五つの嚢胞性線維症変異、およびCFTR遺伝子のイントロン8スプライスアクセプター部位におけるポリ(T)トラクトの三つの一般的アリルを区別するためのテストが提示されています。PROBEに必要なすべての実験ステップは、高スループット診断設定に求められる高い自動化の程度に適応可能です。さらに、蛍光、化学発光、または放射性標識を必要とせず、測定された質量信号ははるかに分析的に明確な信号を提供し、すべての場合において高品質であいまいさのない、簡単に解釈可能な結果に至ります。