NeuroMorph: 電子顕微鏡画像スタックから派生した3Dモデルの形態計測解析および可視化のためのツールセット

連続電子顕微鏡イメージングは細胞や組織の構造を探るために重要です。ブロックフェイス走査型電子顕微鏡法の開発と、その大きな画像スタックをキャプチャする能力、いくつかは近似等方性ボクセルを持つことが特に脳組織の探索に有用であることが証明されています。このため、画像スタックから異なる特徴をセグメンテーションするための多数のアルゴリズムとソフトウェアが作成されました。しかし、これらの3Dモデルのすべてまたは一部に対して結果を表示し、詳細な形態計測分析を行うためのツールはほとんど存在しません。この問題に対処するために、ユーザーがセグメンテーション結果を元の画像スタックとともに表示し、これらのオブジェクトを3Dで操作し、任意の領域の測定を行うことができるソフトウェアツールのコレクション、NeuroMorphを構築しました。この形態計測データを収集するアプローチは、樹状突起スパインや軸索ボトンのような構造の幾何学を分析するためのより迅速な手段を提供します。これは、コンピュータビジョン研究によって提供される迅速な再構成技術と、現在手動セグメンテーション方法を使用して行われているセグメント化された構造からの形状や形の測定を収集する必要性との間のギャップを埋めます。