空間CUTF&Tag：細胞レベルでの空間的に解決されたクロマチン修飾プロファイリング

空間オミクスは、生命科学および生物医学研究の新たなフロンティアとして登場しました。ここでは、in situ CUT&Tag化学、マイクロフルイディクスによる決定論的バーコード化、次世代シーケンシングを組み合わせた、ヒストン修飾の空間的に解決された全ゲノムプロファイリングのための空間-CUT&Tagを紹介します。マウス胚における空間的に解決されたクロマチン状態は、ENCODEリファレンスに従った組織タイプ特異的なエピジェネティック調節を明らかにし、組織スケールでの空間情報を提供します。空間-CUT&Tagは、マウス脳における皮質層発達のエピジェネティック制御と、ヒストン修飾によって決定される細胞タイプの空間パターンを明らかにしました。免疫蛍光イメージングを使用して、1つの核のみを含む20ミクロンの画素を特定することで、in situで単細胞エピゲノムを導出できます。組織における空間クロマチン修飾プロファイリングは、エピジェネティック調節、細胞機能、および正常な生理および病因における運命決定を研究するための新しい機会を提供する可能性があります。