新規タンパク質相互作用の工学：過去の振り返りと現在の進展

新しいディープラーニングに基づくタンパク質構造のモデル化および生成の手法は、タンパク質設計の分野に新たな章を開き、以前は達成不可能だった多くの課題を日常的な作業に変えました。タンパク質結合因子の設計は、タンパク質工学における重要かつ挑戦的なタスクであり、さまざまな治療およびバイオエンジニアリングの問題に対する解決策を提供することを約束する重要な進展を経験しました。ターゲットに対する特異的な表面相補性を持つ新しいタンパク質フォールドが、前例のない高い実験成功率を持つアミノ酸配列によって生成および安定化されます。これらの進展は、AlphaFoldのような新しい構造予測モデルの力と、データ分布を学習し、機能に関連する特徴に基づいて新しい分子をサンプリングすることを可能にする深層生成モデルに大きく起因しています。このレビューでは、結合因子設計アプローチの発展を、最先端の手法とその応用、並びに新しい課題に焦点を当てて議論します。