ゲノム全体スケールでの哺乳動物トランスラトームのポリソーム分画化と分析

mRNA翻訳は遺伝子発現の調節において中心的な役割を果たし、哺乳類細胞における最もエネルギーを消費するプロセスを表します。したがって、mRNA翻訳の失調は、癌を含むさまざまな病理状態において主要な役割を果たすと考えられています。リボソームは新生ポリペプチドの折りたたみを助けるシャペロンもホストしており、新たに合成されたポリペプチドの機能と安定性を調節します。さらに、新しいデータは、リボソームが新たに合成されたポリペプチドのさまざまな翻訳後修飾に関連するシグナル分子のレパートリーのプラットフォームとして機能することを示しています。ここでは、スクロース密度勾配遠心分離を使用したリボソーム分画化の確立された方法について説明します。この方法は、社内開発の「anota」アルゴリズムと組み合わせることで、ゲノム全体スケールでの個々のmRNAの差別的翻訳の直接的な決定を可能にします。さらに、この多用途のプロトコルは、新たに合成されたポリペプチドの折りたたみと分解に中心的な役割を果たすリボソームに関連するタンパク質複合体の機能を解剖することを目的としたさまざまな生化学研究にも使用できます。