陸生植物におけるDNAバーコーディング：成功を定量化し最大化するための基準の開発

植物におけるDNAバーコードの選択は、最もアクセスしやすいプラスチドマーカーで観察される比較的低いヌクレオチド置換率のために一部阻害されています。しかし、コンセンサスの欠如は、潜在的なバーコードマーカーを比較するための基準が不足していることを反映しています。多くの出版物が様々な植物DNAバーコードを提案していますが、これらの研究は、植物におけるDNAバーコードの採用に関連する説得力のある単一の理論を提示していないため、任意の定量的または統計的パラメータを介して相互に容易に比較することができません。ここでは、特定の植物DNAバーコードの選択の有効性は、クエリー配列を種に割り当てる際の結果としてのバーコードデータベースの期待されるパフォーマンスを反映すべきであると主張します。「データベースパフォーマンス」に関連する基準については正当な科学的意見の相違が存在しますが、この概念は選択基準の優先順位を設定するための統一的な論理を提供します。それに応じて、私たちはデータベースパフォーマンスの論理に基づくバーコードの有効性の尺度、「正確な同定の確率」（PCI）を提案します。さらに、PCIの定義は、DNAバーコードを評価する最良の方法についての科学的意見の相違のほとんどに対処できるように柔軟に保たれています。最後に、異なるタイプのバーコードが異なる分析およびデータベース設計の方法を必要とする可能性があることを考慮し、その分析が陸生植物にとって最も広く効果的なバーコードの選択にどのように影響するかを示します。