DR4、DR7、およびw9ハプロタイプにおけるDRベータ1およびDRベータ2サブユニットの構造的関係およびDRw53（MT3）特異性。

DR4、DR7、およびDRw9ハプロタイプのクラスII分子を免疫沈降、次に二次元ゲル電気泳動およびN末端アミノ酸配列決定により分析した。HLA-DR鎖特異的モノクローナル抗体を使用して、2つの異なるDRベータ鎖が同定された。1つのベータ鎖はDRベータ2と呼ばれ、特有の酸性移動度を持っていた。3つのDRタイプすべてにおいて、DRベータ2鎖は二次元ゲル電気泳動および部分的N末端配列決定により区別できなかった。2つ目のDRベータ鎖はベータ1と呼ばれ、二次元ゲル電気泳動でより塩基性の移動度を示し、位置18のフェニルアラニンの一貫した存在によってDRベータ2鎖とは異なっていた。DRベータ2鎖と対照的に、DRベータ1鎖は明確に多型であり、各DRタイプ特有のアミノ酸配列の違いを持っていた。異なる多型エピトープを認識するモノクローナル抗体109d6および17-3-3Sは、DRw53アロスぺシフィシティに相関して異なるDRベータ鎖と反応することがわかった。モノクローナル抗体109d6によって認識されたエピトープは、典型的なDR4、DR7、およびDRw9細胞株のDRベータ2鎖上に同定された。しかし、DR7、Dw11、DQw3細胞株BEIは、DRw53アロデターミナントの存在にもかかわらず、免疫蛍光法または免疫沈降によって抗体109d6と反応しなかった。他のDRw53様モノクローナル抗体17-3-3Sは、テストされたすべてのDR4およびDR7細胞株、BEI細胞株を含む、DRベータ1鎖ではなくDRベータ2鎖と反応した。しかし、抗体17-3-3SはDRw53陽性のDRw9細胞株ISKとは反応しなかった。これらの研究は、DRw53アロスぺシフィティが以前考えられていたよりも複雑であり、2つの異なるDRベータ座位によってコーディングされるいくつかの異なるエピトープを含む可能性があることを示唆している。