セリン/アルギニン豊富なスプライシング因子は、本質的に無秩序なタンパク質のクラスに属する

セリン/アルギニン豊富な(SR)スプライシング因子は、常在スプライシングおよび選択的スプライシング、さらにはRNA代謝のいくつかのステップにおいて重要な役割を果たします。これまでに蓄積されたSRタンパク質に関する機能的情報は豊富ですが、このファミリーのメンバーに関する構造的知識は非常に限られています。SRタンパク質の構造と機能の関係についてより良い洞察を得るために、SRタンパク質ファミリーのメンバーに対して広範な配列解析を行い、順序構造/無秩序構造の予測と組み合わせました。SRタンパク質は、本質的に無秩序な(ID)タンパク質に特徴的な性質を持つことが分かりました。SRタンパク質のアミノ酸組成と配列の複雑さは、無秩序なタンパク質領域のそれに非常に似ていました。より詳細な分析により、SRタンパク質、特にそのRSドメインは、全人間プロテオームと比較して無秩序を促進する残基が豊富で、秩序を促進する残基が欠乏していることが示されました。さらに、無秩序の予測は、SRタンパク質のRSドメインが完全に無構造であることを示しました。異なる2つの分類方法、電荷-疎水性測定および無秩序スコアの累積分布関数(CDF)は互いに一致し、どちらもSRタンパク質ファミリーのメンバーが無秩序であると強く予測しました。この研究は、スプライソソームの組み立てや複数のパートナーとの相互作用など、SRタンパク質のいくつかの機能にとって無秩序な構造の重要性を強調しています。さらに、配列からタンパク質構造を推測するための順序/無秩序予測の有用性を示しています。