カンジダ・アウリス短鎖反復配列タイピングの開発とその世界的孤立株コレクションへの応用

カンジダ・アウリスは、現在、公衆衛生への脅威として認識されている新興の真菌病原体です。この病原体は世界中に広がり、主に病院関連の発生を引き起こします。発生を追跡し、新たな導入と関連付けるために、全ゲノムシーケンシングと増幅断片長多型（AFLP）が分子タイピングに使用されています。全ゲノムシーケンシングは高価で、限られたセンターでしか利用できず、AFLPは複雑な技術で解釈が難しいです。本研究では、C. aurisのゲノムに基づく新しい単純なSTR遺伝子タイプ法を説明します。また、このSTRベースの遺伝子タイピング技術の性能がWGSとほぼ同等であることを示します。全体として、この研究はC. aurisの分子発生調査における新しく迅速、信頼性が高く、コスト効果の高い方法を提供します。