タンパク質におけるアミノ酸相互作用を推測するための最大エントロピーアプローチ

我々は、特定の配列または配列のセットに対するさまざまなタイプの平衡接触の平均数に関連する制約に基づいて、タンパク質中のアミノ酸相互作用を推測するための最大エントロピーアプローチを提示します。非常に有望な結果を得て、2種類のアミノ酸を持つ二次元格子モデルに対していくつかのテストを実施しました。また、接触の平均数が不明な場合でもこの方法が非常によく機能することを示しており、したがって実際のタンパク質に適用することができます。