DILIMOT: 蛋白質における線形モチーフの発見

蛋白質機能モチーフの発見は現代生物学において重要です。3～10 の残基からなる小さなセグメントは、蛋白質相互作用、翻訳後修飾、輸送において重要な役割を果たします。DILIMOT（線形モチーフの発見）は、蛋白質のセット内でこれらの短い線形モチーフを予測するためのサーバーです。共通の機能的特徴（例：相互作用パートナーまたは局在）を共有するシーケンスセットが与えられると、この方法はそれに責任がある可能性が高い統計的に過剰表現されたモチーフを見つけます。入力シーケンスは首先、一連のフィルターを通過して、線形モチーフのインスタンスを含む可能性が低い領域を除去します。モチーフは残りのシーケンス内で見つけられ、関連する種のホモログ間での過剰表現と保存状態を測定する統計に基づいてランキングされます。結果は視覚的なインターフェースで表示され、簡単に閲覧できます。サーバーは http://dilimot.embl.de で利用可能です。