MERFISHによる空間トランスクリプトームプロファイリングは、胎児肝臓の造血幹細胞ニッチの構造を明らかにする

要旨：造血幹細胞（HSC）ニッチは骨髄で広範に研究されてきましたが、胎児肝臓における造血の微小環境調節に関するより体系的な調査が必要です。ここでは、野生型（WT）およびTet2 − / − 胎児肝臓における個々の細胞の空間的組織と転写プロファイルを、多重エラー耐性蛍光 in situ ハイブリダイゼーションにより調査します。特定の組み合わせの胎児肝臓細胞型は互いに隣接して配置される傾向があります。KitlやKitのようなリガンド-受容体シグナル伝達分子ペアは、隣接する細胞型に豊富に存在します。HSCの大部分は、WTおよびTet2 − / − 胎児肝臓の内皮細胞（EC）と直接接触しています。Tet2の喪失はHSCの数を増加させ、HSCニッチにおいてWntおよびNotchシグナル伝達遺伝子を上方調節します。動脈ECと洞様ECの2つのサブタイプのECおよび他の細胞型は、HSCニッチに特異的なシグナル伝達分子を提供します。総じて、この研究は胎児肝臓におけるHSCの空間的調節に関する包括的な視点とバイオインフォマティクスの基盤を提供します。