Key points are not available for this paper at this time.
真空中でデカアラニンを伸ばすための平均力のポテンシャル（PMF）は、パークとシュルテンによって以前に決定されており、彼らの画期的な論文では、誘導分子動力学とジャルジンスキーの非平衡関係を組み合わせることの有効性が示されています。この研究では、最近開発された適応型誘導分子動力学（ASMD）アルゴリズムが使用され、少ない非平衡軌道を平均化することで真空中のデカアラニンの解体のPMFを再現しています。この方法の効率と精度は、パークとシュルテンの以前の研究との一致、他のSMD引っ張り戦略との収束チェックの一連、および解析的証明を通じて示されています。ASMDを通じて得られた非平衡軌道は、伸展座標に沿ったペプチド内水素結合の分析にも使用されています。デカアラニンのヘリックスが伸ばされると、初めに安定化されたi → i + 4接触（α-ヘリックス）はi → i + 3接触（3(10)-ヘリックス）に置き換えられます。i → i + 5水素結合（π-ヘリックス）の有意な形成は観察されませんでした.
Özerら（木曜日）はこの問題を研究しました。