サッカロマイセス・セレビシエの翻訳終結に対する5′コドン文脈の影響

酵母サッカロマイセス・セレビシエにおける生体内翻訳終結を、翻訳アッセイシステムを使用して研究した。ストップコドンに対して-2位で行ったコドンの変化は、放出因子欠損（sup45）突然変異株において3.5倍の終結効果を示し、野生型株で観察された効果と一致した。-2コドンの影響は、新生ペプチド中の対応するアミノ酸残基の正電荷に関連付けることができ、酸性残基が効率的な終結を促進することが分かった。したがって、新生ペプチドのC末端は、細菌大腸菌エシェリヒア・コリと酵母S.セレビシエの翻訳終結に影響を与える。しかし、E.コリとS.セレビシエを比較すると、最後から2番目のアミノ酸の電荷に対する感受性は逆転する。酵母における-1（P-site）コドンの変更は、終結効率に10倍の差をもたらした。この効果は、新生ペプチド中のエンコードされた最後のアミノ酸の特性とは関係がなかった。 同じtRNA（AAA/G, GAA/G）によって読み取られるアイソコドンは、類似のリードスルー値を示した。異なるアイソアセプターtRNAsによって読み取られるグルタミン（CAA/G）、グルタミン酸（GAA/G）、およびイソロイシン（AUA/C）のコドンは、それぞれ終了効率において約2倍の差に関連付けられている。これは、酵母におけるP-site tRNAがUGACにおける終結に影響を与えることができることを示唆している。