フランシセラ・チュラレンシス株の全ゲノムDNAマイクロアレイ解析は、種内での広範な遺伝的保存を示すが、極めて病原性のF.チュラレンシス亜種チュラレンシスに特有の領域を特定する。

フランシセラ・チュラレンシスは強力な病原体であり、可能性のあるバイオテロリズムのエージェントです。しかし、その病原性の分子基盤や、認識されている四つの亜種（F.チュラレンシス亜種チュラレンシス、F.チュラレンシス亜種メディアシアティカ、F.チュラレンシス亜種ホラルクティカ、F.チュラレンシス亜種ノビシダ）の間に見られる病原性の明確な違いを説明するための情報は少ないです。我々は、高病原性株F.チュラレンシス亜種チュラレンシス Schu S4の配列決定に使用されたショットガンライブラリから1,832のクローンに基づくDNAマイクロアレイを開発しました。これにより、すべての四つの亜種を代表する27株の全ゲノム解析が可能になりました。全体として、マイクロアレイ解析はF.チュラレンシス種内の遺伝的変異が限定的であることを確認し、株を比較した際には、せいぜいプローブの3.7%が異なるハイブリダイゼーションを示しました。ハイブリダイゼーションデータのクラスター分析により、A型およびB型チュレミアの原因となる病原体、すなわちF.チュラレンシス亜種チュラレンシスとF.チュラレンシス亜種ホラルクティカはそれぞれ独特のクラスターを形成しました。病原性と地理的起源に顕著な違いがあるにもかかわらず、F.チュラレンシス亜種チュラレンシスとF.チュラレンシス亜種メディアシアティカ株の間には高いゲノムの類似性が明らかでした。日本からの株は別のクラスターに集まり、F.チュラレンシス亜種ノビシダ株も同様でした。0.6から11.5 kbのサイズの8つの差異領域（RD）が特定され、合計で21のオープンリーディングフレームを含み、中程度の病原性を持つ亜種F.チュラレンシス亜種ホラルクティカと高病原性の亜種F.チュラレンシス亜種チュラレンシスを区別しました。これらの領域の一つ、RD1は、初めてF.チュラレンシス特異的PCRアッセイを開発することを可能にし、四つの亜種それぞれを識別しました。