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一部の自生微生物は、動物の消化管のさまざまな部位の上皮表面に局在しています。その中の一つである分節性線状微生物は、マウスとラットの小腸の上皮に局在します。これらの線状微生物は、離乳時にマウスに定着し、成体になるまで少なくとも2ヶ月間持続します。光学および電子顕微鏡の研究結果は、微生物が原核生物であり、上部小腸の上皮細胞と相互作用して接着部位を形成することを示唆しています。この部位は、接着された細菌に隣接する修飾された上皮細胞膜と頂端細胞質で構成されています。微生物はその最初のセグメントの一部でこの部位を満たします。このセグメントの末端には上皮細胞に挿入される乳首のような付属体があります。残りのフィラメントを構成する他のセグメントは通常隔壁によって分かれています。多くの個々のセグメントには、原核生物の細胞と思われる内部セグメント体が含まれています。これらの内部セグメント体の一部は、上皮細胞に挿入された各フィラメントの最初のセグメントに形態的に類似しています。これらの細胞内体は、微生物のライフサイクルの構成要素である可能性があります。この生物は、認識可能な形で培養されたことがありません。したがって、そのような仮説はまだ証明することができず、微生物を確実に分類することもできません。しかし、上部小腸の上皮生息地に局在するため、実験用げっ歯類の消化管エコシステムにおいて特に重要な微生物のタイプである可能性があります。
Davis et al. (1974) はこの問題を研究しました。