최적화된 레너드-존스 매개변수가 소규모 유기 분자를 위한 Martini3 포스 필드를 개선하다

이 연구는 유기 소분자를 위해 설계된 새로운 조잡한 (CG) 포스 필드인 MartiniOLJ의 개발을 제시한다. Martini 프레임워크를 기반으로 하여, 새로운 포스 필드는 일반 GAFF 포스 필드에서 유래한 최적화된 레너드-존스 (LJ) 매개변수를 포함한다. 우리는 DS59 및 DS28 데이터셋에서 총 87개의 유기 소분자를 시뮬레이션하여 MartiniOLJ 포스 필드를 평가하였다. 결과는 MartiniOLJ가 원래 Martini3 포스 필드에 비해 증발 엔탈피 및 용매 자유 에너지를 예측하는 데에서 상당한 개선을 이루고 있음을 나타내지만, 용매 밀도의 추정치는 약간 덜 정확하다. CG 분자 역학 (CGMD) 시뮬레이션은 모든 원자 (AA) 포스 필드에서 최적화된 LJ 매개변수를 통합하는 것이 CG 입자 간 비결합 상호작용의 설명을 효과적으로 향상할 수 있음을 보여준다. 이 연구에서 제안된 최적화 전략은 미래에 더 넓은 범위의 유기 분자를 위한 정확한 CG 모델을 개발하기 위한 체계적이고 이전 가능한 접근법을 제공한다.