중국 닝샤의 유제품 소에서 원유의 미생물 군집의 계절, 집단 특정, 출산 수, 아간과 관련된 변동에 대한 조사

배경 우유 미생물 군집은 유선의 생리학 및 병리학과 밀접한 관련이 있으며, 자손의 발달에 중요한 역할을 합니다. 본 연구의 목적은 계절, 집단 특정, 아간 상태 및 출산 수와 관련된 효과에 따라 우유 미생물 군집 다양성의 변동성을 조사하는 것이 었습니다. 결과 중국 닝샤에서 285마리 소에서 우유 샘플을 수집한 후 16S rRNA 피로시퀀싱을 통해 미생물 군집을 탐색했습니다. 이후 모든 샘플은 계절적 변동(여름 및 겨울), 소 건강 상태(건강한 소 및 아간 소), 농장 출처(6개의 상업적 유제품 농장), 및 출산 수 수준(초산 및 다산)에 따라 분류되었습니다. 박테리아 다양성, 군집 구성 및 풍부함이 독특한 집단에서 평가되었습니다. 또한 여름, 겨울 및 초 유에서 수집된 샘플의 우유 미생물 군집이 비교되었습니다. 결과는 여름과 겨울에서 수집된 샘플 간 우유의 박테리아 다양성이 유의미하게 변동함을 나타냈습니다. 여름 샘플은 겨울 샘플에 비해 더 높은 박테리아 풍부함을 보였습니다. 여름에 수집된 우유 샘플에서는 장 관련 속인 Parabacteroides, Staphylococcus, Corynebacterium₁, Sphingomonas, Lactobacillus가 널리 발견되었습니다. 반대로 겨울 샘플에서는 EscherichiaShigella, Pseudomonas, Streptococcus, Psychrobacter, Rhizobium, Bifidobacterium, Clostridiumₛensuₛtricto₁이 일반적으로 관찰되었습니다. 아간 소는 건강한 소(여름)에 비해 유의미하게 높은 알파 다양성 값(Chao1 및 Shannon 지수)을 보였습니다. Sporolactobacillus, Mycobacterium, EscherichiaShigella 및 Actinomycetaceae는 아간 소에서 바이오마커로 확인되었습니다. 또한 여름에 건강한 소에 비해 아간 그룹에서 상위 20개 KEGG 경로가 유의미하게 감소하였으며, 특히 막 수송, 세포 운동 및 신호 전달 경로에서 감소했습니다. 다양한 농장에서 박테리아 다양성이 변동하였으며, A 농장과 B 농장은 우유 박테리아 구성의 유사성이 높은 반면, D 농장과 F 농장에서도 유사성을 보였습니다. C 농장은 다른 농장들과 차별화된 모습이 나타났습니다. 또한 다산 소가 초산 소에 비해 더 높은 박테리아 풍부함을 보였습니다. 그리고 비교 분석 결과 여름, 겨울 및 초 유 샘플 간 알파 및 베타 다양성, 박테리아 프로필에서 유의한 차이가 발견되었습니다. 결론 본 연구는 우유 미생물 군집의 구성 요소가 계절, 농장, 건강 상태 및 출산 수에 따라 변동성을 보인다는 것을 나타냈습니다. 또 여름, 겨울 및 초유 단계에서 얻은 우유 샘플에서 뚜렷한 미생물 군집 특성이 관찰되었습니다.