플레이북 워크플로우 빌더: 마이크로서비스 네트워크에서 생물정보학 워크플로우의 대화형 구성

초록 많은 생물의학 연구 프로젝트는 가설 생성을 위한 연구 커뮤니티의 자원으로 활용될 수 있는 대규모 데이터셋을 생성합니다. 생물의학 디지털 객체의 검색 가능성, 접근 가능성, 상호 운용성 및 재사용성(FAIR)을 지원하는 인프라를 개발하는 목표를 위해, 현재 여러 자원의 데이터와 도구를 아우르는 복잡한 쿼리는 쉽게 수행될 수 없습니다. 여러 리포지토리와 생물정보학 도구에서 지식을 제공하는 기존 FAIR 응용 프로그래밍 인터페이스(API)를 활용함으로써, 이 API들을 함께 사용하여 다양한 유형의 복잡한 쿼리와 워크플로우를 생성할 수 있습니다. 플레이북 워크플로우 빌더(PWB)는 사용자들이 생태계의 기여로 지속적으로 증가하는 입력 데이터셋, 의미적으로 주석이 달린 API 끝점, 데이터 시각화 도구를 활용할 수 있도록 하여 워크플로우의 대화형 구성을 촉진하는 웹 기반 플랫폼입니다. 사용자 친화적인 웹 기반 사용자 인터페이스(UI)를 통해, 기술 전문 지식 없이 기여된 빌딩 블록으로부터 워크플로우를 구성할 수 있습니다. 워크플로우의 각 단계의 결과는 텍스트 설명, 대화형 및 다운로드 가능한 도표와 표를 포함한 보고서로 제공됩니다. PWB가 여러 자원에서 지식을 추출하여 의미 있는 가설을 생성할 수 있는 능력을 보여주기 위해 몇 가지 사용 사례를 제시합니다. 예를 들어, 이러한 사용 사례 중 하나는 GTEx, LINCS, 대사체학, GlyGen 및 ExRNA 커뮤니케이션 컨소시엄(ERCC) 공통 기금(CF) 데이터 조정 센터(DCCs)에서 데이터를 사용하여 개별 암 환자에 대한 새로운 타겟을 선별합니다. PWB로 생성된 워크플로우는 게시 및 재사용되어 다른 입력을 사용하여 유사한 사용 사례를 해결할 수 있습니다. PWB 플랫폼은 다음에서 이용할 수 있습니다: https://playbook-workflow-builder.cloud/.