종양-나이브 세포 프리 메틸롬 및 파편롬의 초기 변화가 펨브롤리주맙 치료에 대한 고형 종양의 결과를 예측하는 보조 그림 6

비부정 행렬 분해는 짧은 파편 길이와 더 큰 뉴클레오솜 핵의 점유율과 관련된 특성 암 관련 서명을 식별합니다. (A) 전 유전체 파편 길이는 두 구성 요소 비부정 행렬 분해 분석의 특징으로 사용되었습니다. 이 분석은 더 긴 구성 요소와 더 짧은 구성 요소를 드러냈습니다. 짧은 구성 요소의 가중치는 정상 대조군에 비해 암 환자의 세포 프리 DNA에서 높아졌습니다. (B) 파편 끝과 뉴클레오솜 중심 간의 거리도 두 구성 요소 비부정 행렬 분해의 특징으로 사용되었습니다. 이 분석은 서로 다른 비율의 내부 뉴클레오솜 파편 끝을 가진 두 가지 구성 요소를 드러냈습니다. 내부 뉴클레오솜 파편 끝이 더 많은 특징은 정상 대조군에 비해 암 환자의 세포 프리 DNA에서 높아졌습니다. (C) 뉴클레오솜 핵 내에서 파편 끝의 위치를 나타내는 히트맵으로, 뉴클레오솜 피크의 50 bp 이내에 포함됩니다. 그룹 및 총 cfMeDIP-seq 점수에 따라 정렬하면, 추정된 ctDNA 수치가 더 높은 경우 뉴클레오솜 핵 내에서 종료된 읽기 끝의 비율이 더 높음을 관찰합니다.