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스파르티나 알터니플로라(Spartina alterniflora)는 해안에서 잘 자랄 수 있는 외부 분비 내염성 Poaceae 종이지만, 염분 내성에 대한 적응의 유전적 기초는 여전히 알 수 없습니다. 여기에서는 PacBio HiFi 염기서열 분석, 고속 크로모좀 형태 포획(Hi-C) 기술, 그리고 Illumina 기반 전사체 분석을 결합하여 생성된 S. alterniflora의 고품질 염색체 수준의 유전체 조립 결과를 보고합니다. 최종 1.58 Gb 유전체 조립체는 N50 사이즈가 46.74 Mb입니다. 계통학적 분석에 따르면, S. alterniflora는 약 2,172만년(MYA) 전에 Zoysia japonica에서 분기한 것으로 보입니다. 또한, S. alterniflora에서 발생한 전체 유전체 복제(WGD) 사건은 염분 내성과 염수 환경에 대한 적응과 관련된 유전자 가족 및 전사인자를 확장시킨 것으로 보입니다. 비교 유전체 분석을 통해 '이온 수송' 및 '염분 스트레스 반응'에 풍부한 다수의 종 특이적 유전자, 현저하게 확장된 유전자 및 긍정적으로 선택된 유전자가 확인되었습니다. RNA-seq 분석에서는 높은 친화성 K 이온 수송체 유전자 여러 개가 확인되었습니다.
Chen et al. (Mon,)은 이 문제를 연구했습니다.