아프리카 인구에서 새로운 구순열 유전자를 제안하는 희귀 변이 분석

초록 비증후군 구강 안면 기형(NSOFC)은 복잡한 원인을 가진 일반적인 출생 결함입니다. 60개 이상의 일반적인 위험 유전자가 확인되었지만, 이는 NSOFC의 유전적 변이를 설명하는 극히 일부에 불과합니다. 희귀 변이에 의해 누락된 유전적 변이가 관련이 있습니다. 따라서, 본 연구는 NSOFC와 관련된 비동의 희귀 코딩 변이가 풍부한 유전자를 식별하는 것을 목표로 하였습니다. 샘플에는 814명의 비증후군 구순열(구개 유무 포함), 205명의 비증후군 구개열만 있는 어린이, 그리고 나이지리아, 가나, 에티오피아의 2150명의 무관한 대조군 어린이가 포함되었습니다. 우리는 세 가지 희귀 변이 집합 모델을 사용하여 각 표현형에 대해 유전자 기반 분석을 개별적으로 수행하였습니다: (1) 단백질 변화 변이(PA), (2) 미스센스 변이만(MO); 및 (3) 기능 상실 변이만(LOFO). 그 후, 관련된 전사체 데이터를 활용하여 연관된 유전자 발현을 평가하고, gnomeAD 데이터베이스를 사용하여 이들의 변이 제약을 조사하였습니다. 총 13개의 유전자가 제안되는 연관성을 보였습니다(p = E-04). 이 중, 8개의 유전자(ABCB1, ALKBH8, CENPF, CSAD, EXPH5, PDZD8, SLC16A9, TTC28)는 얼굴 형성 과정에서 관련된 마우스 및 인간의 두개안면 조직에서 일관되게 발현되었으며, 3개의 유전자(ABCB1, TTC28, PDZD8)는 통계적으로 유의미한 변이 제약을 보였습니다. 이러한 발견은 NSOFC를 위한 후보 유전자를 식별하는 데 있어 희귀 변이의 역할을 강조합니다. 본 문서의 주요 내용(방법 섹션 제외) 단어 수: 2145