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초록 신장 근위 세뇨관 상피 세포는 손상 후 상당한 내재적 수리 능력을 가지고 있습니다. 그러나 손상된 근위 세뇨관 세포의 일부는 정상적인 수리를 거치지 못하고, 섬유증 및 만성 신장 질환을 촉진할 수 있는 친염증성 및 섬유화형 표현형을 가집니다. 건강한 수리에서 실패한 수리로의 변화는 세포 상태 특이적인 전사체 및 후생유전체 변화를 통해 표시됩니다. 단일 핵 동시 RNA 및 ATAC-seq 시퀀싱은 이러한 변화를 뒷받침하는 유전자 조절 네트워크를 연구할 기회를 제공합니다. 우리는 다오믹 데이터 세트를 사용하여 전유전체 매개변수 유전자 조절 네트워크를 구성하기 위해 정규화 회귀 접근 방식을 개발합니다. 우리는 7개의 성인 인간 신장 샘플에서 단일 핵 다오믹 데이터 세트를 생성하고, 이 방법을 적용하여 신장 질환과 관련된 실패한 손상 반응의 유도인자를 연구합니다. 우리의 접근 방식이 건강한 수리에서 실패한 수리로의 전환을 뒷받침하는 주요 cis- 및 trans- 조절 요소를 예측하는 데 매우 효과적인 도구임을 보여 주며, NFAT5를 부적응성 근위 세뇨관 상태의 유도인자로 식별하는 데 사용합니다.
Ledru et al. (Mon,)은 이 질문을 연구했습니다.