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이 논문은 2010년 이전 리뷰 이후의 변화 및 추가 사항을 강조하며, MolProbity 웹사이트에서 제공되는 거대 분자 모델 검증 서비스에 대한 최근 업데이트를 설명합니다. Java 유틸리티를 기존 또는 새로 작성된 Python 유틸리티를 사용하는 형태로 재작성하는 등 많은 인프라 개선이 있었습니다. 이를 통해 장기적인 유지 관리가 개선되고 MolProbity 스타일의 검증이 Phenix에 철저히 통합되었습니다. 현재 http://molprobity.manchester.ac.uk에서 완전한 MolProbity 미러 사이트가 운영되고 있습니다. GitHub는 우리의 오픈 소스 코드, 참조 데이터 세트 및 대부분의 검증 기준을 정의하는 결과 다차원 분포를 제공합니다. Asn/Gln/His "플립" 수정 후의 좌표 출력은 과거에는 종종 건너뛰었던 후 수정 단계 때문에 보다 이상적으로 개선되었습니다. X-ray 결정학에 적합한 전자 구름 중심 위치와 핵 위치를 위한 두 가지 별개의 원자-수소 거리 및 동반되는 반데르발스 반경 세트가 연구되어 정확성이 개선되었습니다. 새로운 검증에는 문제를 일으키는 형식 불규칙성에 대한 입력 메시지, 새로운 참조 데이터 세트의 백만 개 품질 필터링된 잔기에서 Ramachandran 및 로타머 기준의 업데이트, cryoEM 또는 저해상도 X-ray에 대한 CaBLAM Cα-CO 가상 각도 분석, 최근 과도하게 사용된 매우 드문 cis-nonProline 및 비틀린 펩타이드의 플래깅이 포함됩니다. 연구 커뮤니티, Phenix 및 전 세계 단백질 데이터 뱅크에서 MolProbity 검증 및 수정의 폭넓은 적용 덕분에, 새로 배치된 구조는 MolProbity의 독특한 전원자 충돌 점수로 측정할 때 계속해서 크게 향상되고 있습니다.
Williams et al. (Wed,)는 이 질문을 연구했습니다.