벤틸리오 콜레라균은 전 세계적으로 중요한 병원체로, 풍토병 및 유행성 콜레라를 일으키며 산발적인 위장염과 식중독과도 관련이 있습니다. 방글라데시에서 새우 수출은 주요 수익 및 고용원입니다. 그러나 벤틸리오균의 발병은 해산물 소비를 통한 심각한 공중보건 및 사회경제적 위험과 항생제 내성 유전자의 수산양식 전파를 초래합니다. 본 연구는 방글라데시 수산양식 환경을 중심으로 해산물 관련 벤틸리오 콜레라균 균주의 유전체 및 병원성 특성을 조사합니다. Oxford Nanopore 장기염기서열 분석기술을 이용해 방글라데시 노아칼리에서 태평양 흰다리새우에서 분리한 V. cholerae SU129B 균주에 대해 전체 유전체 서열분석(WGS)을 수행하여 유전적 다양성, 항균제 내성 및 병원 인자를 탐색했습니다. 조립된 게놈은 높은 완전도(93.08%)와 연속성(N50=1)을 보였고, 오염도는 최소(1.33%)였습니다. 평균 핵산 일치도(ANI) 분석 결과 참조 균주 RFB16과 98.13% 유사하여 종 수준 동정을 확인했습니다. 기능 및 경로 분석에서는 다양한 환경에서 생존에 기여하는 복잡한 유전자 및 대사 시스템 네트워크를 가지고 있음을 나타냈습니다. 게놈 분석은 삼차대사산물 생합성에 관련된 여러 유전자 클러스터를 밝혀 삼투내성과 금속 획득에 기여함을 보여주었습니다. 또한 다양한 배출 시스템, 표적 변형, 막 적응 기작을 통한 내성을 부여하는 다수 항생제 내성 유전자가 존재했습니다. 판게놈 분석 결과 8,964개의 유전자(코어 유전자 2,085, 소프트코어 429, 셸 1,431, 클라우드 5,019)를 확인하여 상당한 유전적 다양성과 적응력을 증명했습니다. 계통발생 분석에서는 새우 및 임상 균주 간 밀접한 진화적 관련성을 보여 환경 및 임상 분리주의 게놈 보존 가능성을 시사했습니다. 본 연구 결과는 V. cholerae SU129B 균주가 수산양식 환경에서 진화할 수 있으며, 병원성과 다중약제 내성의 저장소 역할을 할 수 있음을 보여줍니다.
Uddin 등(Tue,)이 이 문제를 연구했습니다.
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