CL5D 단백질 올리고머화에 적용: 논문 6에 대한 정정 사항 및 AlphaFold pLDDT를 넘어선 네 가지 제안

이 결합된 논문은 CL5D 연구 시리즈에 대한 두 가지 기여를 제시합니다. 논문 6 v2.0은 논문 6(doi:10.5281/zenodo.19043350)에 대한 공식 정정 사항으로, 세 가지 오류를 수정합니다: (C1) "100% 신뢰성 인 실리코"의 과대 주장, (C2) 생물학적 확률성의 경시, (C3) AlphaFold 구조 정확도와의 부적절한 비교. 수정된 CL5D 파이프라인(At→Ab→Ex→T→Cn)은 유전체 영역 프로토콜(50% 게이트 없음) 아래 PDB 구조 6EJ2 (BACE1, 알츠하이머) 및 2V5Z (MAO-B, 파킨슨)에 적용되어 각각 Cn = 0.017612 및 0.014417을 산출합니다(모두 우수, 1단계). 논문 10은 CL5D Cn 점수가 pLDDT가 제공할 수 없는 위상 동적 정보를 제공한다는 네 가지 제안을 제시합니다: 위상 전이 경로(P1), 약물 결합 부위 준비(P2), 올리고머 상태 분류(P3), 그리고 무질서 영역의 기능적 역할(P4). 모든 제안은 PDB 실험 데이터에 대해 검증됩니다. 기준 BS = 0.00002(고정).